Начало своей истории Калининский районный суд берет с момента разделения Дзержинского района. В связи с увеличением населения Дзержинского района 20 октября 1980 года, в соответствии с Указом Президиума Верховного Совета РСФСР «Об образовании Калининского района в городе Новосибирске и Новосибирской области» был образован новый район в городе Новосибирске – Калининский. В марте 1981 года начал работу Калининский районный народный суд. Первый приказ в суде был издан 6 марта 1981 года. Этот день стал официальной датой образования Калининского суда.
Свою работу Калининский районный народный суд начал под председательством Темирсултановой Галины Николаевны. Становление суда пришлось на непростой период перестройки, когда в обществе зарождалась идея о самостоятельности и независимости судебной власти.
Суд разместился в деревянном двухэтажном здании на улице Народная, дом 48. Вместе с Галиной Николаевной в Калининском суде трудились Родина Фаина Васильевна, Серебренников Владимир Филимонович, Васильков Юрий Константинович. Немногочисленный, но опытнейший коллектив судей с энтузиазмом начал работу в молодом, строящемся и развивающемся районе города.
Председателем Калининского районного народного суда в 1989 г. была избрана Якубовская Валентина Николаевна, ранее работавшая судьей Дзержинского районного народного суда г. Новосибирска. Поскольку Якубовская В.Н. уделяла большое внимание по комплектованию штата судей, их обучению, то следующей её задачей был, переезд суда в другое здание в связи с тем, что занимаемое ветхое помещение не соответствовало санитарным и гигиеническим нормам.
В 1991 г. суд переехал в здание бывшего училище по ул. Учительская 40а, где и располагается в настоящее время.
С 1989 по 2013 год Калининский суд возглавляла Якубовская Валентина Николаевна, которая являлась бессменным руководителем суда на протяжении 24 лет.
В 2013 году председателем Калининского районного суда была назначена Ступчикова Ирина Александровна.
С мая 2021 года председателем Калининского районного суда является Мяленко Мария Николаевна.